Mikrobiologische Untersuchungen

Die Mikrobiologie befasst sich mit der Untersuchung von Mikroorganismen wie Bakterien, Viren, Pilzen und Parasiten, die bei Tieren Krankheiten verursachen können. Durch präzise Diagnostik identifizieren wir die Erreger, bestimmen ihre Empfindlichkeit gegenüber Antibiotika und unterstützen Sie in der Praxis bei der Auswahl der optimalen Therapiestrategie.

ZWIERZĘTA TOWARZYSZĄCEKONIE

fot. Anna Bogucka

DIAGNOSTYKA MYKOLOGICZNA

Zwierzęta towarzyszące

Bakteriologische Untersuchung

Materiał

  • Abstriche aus Wunden, Nase, Maulhöhle, Ohr etc.
  • Körperflüssigkeiten
  • Urin
  • Kot
  • Milch

Präanalytik

Für eine aussagekräftige Diagnostik wird das Material vor der Verabreichung von Medikamenten, insbesondere topischen Medikamenten, entnommen.

Wenn die Behandlung bereits begonnen wurde, sollte die Probe vor der Gabe nächsten Dosis entnommen werden, wenn die Medikamentenkonzentration am niedrigsten ist.

Preparat bezpośredni

Do wymazu zalecane jest dodatkowe dołączenie preparatu bezpośredniego na szkiełku podstawowym, w celu oceny pod kątem obecności grzybów drożdżopodobnych (informacja dodatkowo uwzględniona jest na wyniku).

Lagerung und Transport

Nicht steriles Material wie Spontanurin, Kot, TBS oder BAL-Flüssigkeit sollte bei 4–8 °C gelagert werden, um Pilzwachstum zu verhindern. Das Material sollte innerhalb von 24 Stunden nach der Entnahme im Labor verarbeitet werden.

DERMATOPHYTEN

Materiał

  • Haare mit Wurzeln
  • Krallen
  • Geschabsel

Das Material sollte am Rand der Läsion entnommen werden. Haare sollten nicht im Zentrum entnommen werden, da dort die Regeneration gesunder Haare am schnellsten erfolgt und sich dort abgestorbene Pilzzellen befinden.

Materialien für Dermatophytentests sollten vor Beginn der antimykotischen Therapie oder mindestens 4 Wochen nach Abschluss der Behandlung entnommen werden. Bei der Anwendung systemischer Antimykotika ist die Eliminationszeit zu berücksichtigen, die von der Pharmakokinetik des jeweiligen Medikaments abhängt.

Lagerung und Transport

Das gesammelte Material sollte in einem sterilen, trockenen Behälter aufbewahrt werden, um eine Kontamination mit Mikroorganismen aus der Umwelt zu verhindern.

Wir empfehlen, das Material bei Raumtemperatur zu lagern und innerhalb von 48 Stunden an das Labor zu liefern.

Welchen Test sollte man wählen?

Kultur PCR
Hier erkennt man ausschließlich lebende Dermatophyten. Daher wird die Kultur auch zur Therapieüberwachung empfohlen. Erkennt auch abgestorbene Dermatophyten.
Das Wachstum von Dermatophyten kann durch das Wachstum von Schimmelpilzen gehemmt werden. Höhere Sensitivität (kein Einfluss von Umgebungskeimen auf das Testergebnis).
Möglichkeit zum Nachweis seltener Dermatophytenarten. Erkennt die wichtigsten Arten (Trichophyton spp., Microsporum canis, Nannizia gypsea).
Geringere Kosten, aber längere Wartezeit auf die Ergebnisse (10–21 Tage). Höhere Kosten, aber das Ergebnis innerhalb von 3–7 Tagen.

Was bedeutet Kontamination?

Dermatophyten wie Microsporum und Trichophyton sind keratinophile Fadenpilze, die sich unter anderem durch eine langsame Wachstumsrate auszeichnen. Trotz der Verwendung von Kulturmedien, die das Schimmelwachstum hemmen sollen, kann es dennoch zu Mischwachstum von Pilzen kommen, die keine Dermatophyten sind. Ein solches Wachstum deutet auf eine Kontamination hin. In diesem Fall kann das Vorhandensein pathogener Pilze in der Probe möglicherweise nicht durch eine Kultur bestätigt oder ausgeschlossen werden.

ASPERGILLUS SPP. (GRZYBY PLEŚNIOWE)

Materiał

  • wymaz na podłożu oraz bez podłoża
  • popłuczyny z dróg oddechowych

Materiał do badania należy pobrać z tego samego miejsca na dwa jałowe i zwilżone solą fizjologiczną wymazy, z czego jeden umieścić w podłożu transportowym a drugi przesłać bez podłoża.

Przechowywanie oraz transport

Popłuczyn z dróg oddechowych należy przechowywać w temperaturze 4 – 8° C aby zapobiec namnażaniu grzybów w próbce. Materiał powinien zostać opracowany w ciągu 24 godzin od pobrania.

Uwagi

Należy mieć na uwadze, że grzyby pleśniowe są szeroko rozpowszechnione w środowisku, dlatego też w przypadku hodowli nietypowych grzybów pleśniowych (innych niż Aspergillus), zaleca się powtórzenie badań w celu eliminacji przypadkowej mykobioty i potwierdzenie ewentualnego czynnika etiologicznego.

Oberflächenmykose bei Reptilien

Hodowla

W ramach wykonywanego profilu, uwzględniane są zarówno grzyby pleśniowe, dermatofity oraz grzyby drożdżopodobne. Bardzo ważne jest aby do badania dostarczyć wystarczającą ilość materiału, pozwalającą na założenie hodowli w kierunku wymienionych grzybów. Należy mieć na uwadze, że wilgotne środowisko  w którym żyją zwierzęta, sprawia, że grzyby izolowane również są od osobników bez objawów klinicznych, w szczególności dotyczy to grzybów z rodzaju Aspergillus, Penicillium, Rhizopus, Mucor, Trichosporon, Rhodotorula, Candida.

Materiał

  • wymaz w podłożu transportowym oraz zeskrobina

Należy zwrócić uwagę, że niektóre grzyby izolowane od gadów, mogą wymagać dodatkowej identyfikacji w postaci sekwencjonowania, dlatego też czas oczekiwania w przypadku np. podejrzenia Nannizzopsis guarroi / vriesii może ulec wydłużeniu.

Dodatkowe badania

 

Metarhizium spp (PCR)

Materiał: wymaz bogatokomórkowy

 

Nannizziopsis quarroi (PCR)

Materiał: wymaz bogatokomórkowy ze skóry lub narządy

 

Ophidiomyces ophiodiicola (węże)(PCR)

Materiał: wymaz bogatokomórkowy lub wycinek skóry

DIAGNOSTYKA MYKOLOGICZNA

Konie

GRZYBY DROŻDŻOPODOBNE

Materiał

  • wymaz agarowy z nosa, narządu wzroku
  • popłuczyny z tchawicy lub macicy
  • świeży kał

Uwagi

Najbardziej przydatny w diagnostyce jest materiał pobrany przed podaniem leków, zwłaszcza o działaniu miejscowym. Jeżeli już wdrożono leczenie, materiał należy pobrać przed podaniem kolejnej dawki, gdy stężenie leku jest najniższe.

Przechowywanie oraz transport

Materiał pochodzący z próbek z części ciała, które nie są jałowe, np. moczu, kału, popłuczyn TTW czy BAL należy przechowywać w temperaturze 4 – 8° C aby zapobiec namnażaniu grzybów w próbce. Materiał powinien zostać opracowany w ciągu 24 godzin od pobrania.

GRZYBY PLEŚNIOWE

W ramach badania izolowane są m.in. : Aspergillus spp., Penicillum spp., Mucor spp.,  Alternaria spp.

Materiał

  • wymaz na podłożu oraz bez podłoża
  • popłuczyny z dróg oddechowych lub macicy

Materiał do badania należy pobrać z tego samego miejsca na dwa jałowe i zwilżone solą fizjologiczną wymazy, z czego jeden umieścić w podłożu transportowym a drugi przesłać bez podłoża.Ze względu na możliwe zanieczyszczenia grzybami pleśniowymi, nie zaleca się pobierania wymazu ze skóry.

Przechowywanie oraz transport

Popłuczyn z dróg oddechowych należy przechowywać w temperaturze 4 – 8°C aby zapobiec namnażaniu grzybów w próbce. Materiał powinien zostać opracowany w ciągu 24 godzin od pobrania.

DERMATOFITY

Materiał

  • włosy / sierść wraz z cebulkami
  • zeskrobiny

Materiał należy pobrać na granicy zmian.  Nie powinno się pobierać włosów z centrum, gdyż tam najszybciej postępują procesy odbudowy zdrowego włosa oraz znajdują się martwe komórki grzyba. Materiały do badań na dermatofity pobiera się od pacjentów przed rozpoczęciem terapii przeciwgrzybiczej lub po upływie co najmniej 4 tygodni od momentu zakończenia leczenia. W przypadku stosowania leków przeciwgrzybiczych o działaniu ogólnym, należy wziąć pod uwagę czas, który jest konieczny do eliminacji leku z organizmu i zależy od farmakokinetyki określonego preparatu.

Przechowywanie oraz transport

Pobrany materiał należy umieścić w jałowym, suchym pojemniku, tak aby zapobiec kontaminacji drobnoustrojami / grzybami środowiskowymi.

Zalecamy przechowywać w temperaturze pokojowej i dostarczyć do laboratorium w ciągu maksymalnie 48 h.

Które badanie wybrać?

 

Hodowla PCR
Wykrywa wyłącznie żywe dermatofity – dlatego zalecana jest również do kontroli leczenia. Wykrywa również martwe dermatofity.
Wzrost dermatofitów może być hamowany wzrostem grzybów pleśniowych. Wyższa czułość (brak wpływu pleśni na wynik badania).
Możliwość wykrycia rzadkich gatunków dermatofitów. Wykrywa najważniejsze gatunki (Trichophyton spp., Microsporum canis, Nannizia gypsea)​.
Niższy koszt, ale dłuższy czas oczekiwania na wynik (10-21 dni). Wyższy koszt, ale wynik w ciągu 3 – 7 dni.

Co oznacza kontaminacja?

Dermatofity takie jak Microsporum czy Trichophyton to keratynofilne grzyby strzępkowe, które charakteryzują się m.in. powolnym tempem wzrostu. Pomimo stosowania podłóż hodowlanych, które  mają za zadanie zahamowanie wzrostu pleśni, dalej istnieje możliwość uzyskania mieszanego wzrostu grzybów innych niż dermatofity. Taki wzrost wskazuje na kontaminację, w przypadku której  może nie być możliwości potwierdzenia lub wykluczenia obecności w próbce grzybów patogennych metodą hodowlaną.